Prezentace DokuWiki je z větší části zajištěna prostřednictvím šablony. Šablony obsahují výchozí sadu CSS stylů, kterou lze snadno rozšířit a přizpůsobit. Pluginy často přidávají i vlastní CSS styly.
Nejjednodušší způsob, jak upravit některé vybrané parametry vzhledu, je použít vestavěný Plugin Styling.
Další úpravy je možné provést pomocí uživatelských stylů, které umožňují přidávat vlastní styly způsobem, který je zachová i při aktualizacích.